Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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