Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcsamQ6RFH4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GcsamQ6RFH4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcsamQ6RFH4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GcsamQ6RFH4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcsamQ6RFH4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GcsamQ6RFH4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcsamQ6RFH4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms