Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nudcd1Q6PIP5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nudcd1Q6PIP5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nudcd1Q6PIP5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nudcd1Q6PIP5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nudcd1Q6PIP5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nudcd1Q6PIP5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nudcd1Q6PIP5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nudcd1Q6PIP5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nudcd1Q6PIP5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nudcd1Q6PIP5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nudcd1Q6PIP5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nudcd1Q6PIP5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nudcd1Q6PIP5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nudcd1Q6PIP5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms