Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1a2Q6PIE5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1a2Q6PIE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1a2Q6PIE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1a2Q6PIE5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a2Q6PIE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1a2Q6PIE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a2Q6PIE5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1a2Q6PIE5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1a2Q6PIE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1a2Q6PIE5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a2Q6PIE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1a2Q6PIE5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp1a2Q6PIE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp1a2Q6PIE5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp1a2Q6PIE5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms