Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrn2Q6PHP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrn2Q6PHP6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrn2Q6PHP6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrn2Q6PHP6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrn2Q6PHP6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrn2Q6PHP6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrn2Q6PHP6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrn2Q6PHP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrn2Q6PHP6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrn2Q6PHP6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrn2Q6PHP6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrn2Q6PHP6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrn2Q6PHP6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrn2Q6PHP6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrn2Q6PHP6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrn2Q6PHP6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrn2Q6PHP6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrn2Q6PHP6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms