Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc82Q6PG04 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc82Q6PG04 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc82Q6PG04 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc82Q6PG04 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc82Q6PG04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc82Q6PG04 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc82Q6PG04 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc82Q6PG04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc82Q6PG04 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc82Q6PG04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc82Q6PG04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc82Q6PG04 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc82Q6PG04 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc82Q6PG04 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc82Q6PG04 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc82Q6PG04 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc82Q6PG04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc82Q6PG04 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc82Q6PG04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc82Q6PG04 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc82Q6PG04 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc82Q6PG04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc82Q6PG04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc82Q6PG04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms