Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Ttbk1Q6PCN3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Ttbk1Q6PCN3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Ttbk1Q6PCN3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40,9■■■■■ 4,14
Ttbk1Q6PCN3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40,88■■■■■ 4,14
Ttbk1Q6PCN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40,82■■■■■ 4,13
Ttbk1Q6PCN3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
Ttbk1Q6PCN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
Ttbk1Q6PCN3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Ttbk1Q6PCN3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40,78■■■■■ 4,12
Ttbk1Q6PCN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Ttbk1Q6PCN3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Ttbk1Q6PCN3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40,74■■■■■ 4,11
Ttbk1Q6PCN3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Ttbk1Q6PCN3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Ttbk1Q6PCN3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,11
Ttbk1Q6PCN3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Ttbk1Q6PCN3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Ttbk1Q6PCN3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Ttbk1Q6PCN3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Ttbk1Q6PCN3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Ttbk1Q6PCN3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Ttbk1Q6PCN3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Ttbk1Q6PCN3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Ttbk1Q6PCN3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Ttbk1Q6PCN3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40,58■■■■■ 4,09
Ttbk1Q6PCN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,57■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40,48■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Ttbk1Q6PCN3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Ttbk1Q6PCN3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Ttbk1Q6PCN3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Ttbk1Q6PCN3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Ttbk1Q6PCN3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
Ttbk1Q6PCN3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Ttbk1Q6PCN3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Ttbk1Q6PCN3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Ttbk1Q6PCN3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Ttbk1Q6PCN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40,32■■■■■ 4,04
Ttbk1Q6PCN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Ttbk1Q6PCN3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Ttbk1Q6PCN3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Ttbk1Q6PCN3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Ttbk1Q6PCN3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Ttbk1Q6PCN3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Ttbk1Q6PCN3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Ttbk1Q6PCN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Ttbk1Q6PCN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Ttbk1Q6PCN3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,19■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,02
Ttbk1Q6PCN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Ttbk1Q6PCN3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40,11■■■■■ 4,01
Ttbk1Q6PCN3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,1■■■■■ 4,01
Ttbk1Q6PCN3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Ttbk1Q6PCN3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Ttbk1Q6PCN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40,03■■■■■ 4
Ttbk1Q6PCN3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40,02■■■■■ 4
Ttbk1Q6PCN3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Ttbk1Q6PCN3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3,99
Ttbk1Q6PCN3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Ttbk1Q6PCN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Ttbk1Q6PCN3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39,94■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,93■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,93■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39,89■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39,89■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,98
Ttbk1Q6PCN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Ttbk1Q6PCN3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,9 ms