Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd3Q6P9Z1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd3Q6P9Z1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd3Q6P9Z1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarcd3Q6P9Z1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd3Q6P9Z1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcd3Q6P9Z1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd3Q6P9Z1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd3Q6P9Z1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd3Q6P9Z1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd3Q6P9Z1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd3Q6P9Z1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms