Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmgb4Q6P8W9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hmgb4Q6P8W9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmgb4Q6P8W9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmgb4Q6P8W9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmgb4Q6P8W9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgb4Q6P8W9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgb4Q6P8W9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmgb4Q6P8W9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hmgb4Q6P8W9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgb4Q6P8W9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb4Q6P8W9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmgb4Q6P8W9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmgb4Q6P8W9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms