Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gga2Q6P5E6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gga2Q6P5E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gga2Q6P5E6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gga2Q6P5E6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga2Q6P5E6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga2Q6P5E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gga2Q6P5E6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga2Q6P5E6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms