Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snx19Q6P4T1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx19Q6P4T1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx19Q6P4T1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx19Q6P4T1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx19Q6P4T1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx19Q6P4T1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx19Q6P4T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx19Q6P4T1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx19Q6P4T1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx19Q6P4T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx19Q6P4T1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx19Q6P4T1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx19Q6P4T1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx19Q6P4T1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx19Q6P4T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx19Q6P4T1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx19Q6P4T1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx19Q6P4T1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx19Q6P4T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx19Q6P4T1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx19Q6P4T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms