Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4P1

Serpina3a, Serine protease inhibitor A3A, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina3aQ6P4P1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpina3aQ6P4P1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Serpina3aQ6P4P1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serpina3aQ6P4P1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Serpina3aQ6P4P1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Serpina3aQ6P4P1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Serpina3aQ6P4P1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Serpina3aQ6P4P1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Serpina3aQ6P4P1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Serpina3aQ6P4P1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serpina3aQ6P4P1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms