Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Soga3Q6NZL0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga3Q6NZL0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga3Q6NZL0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga3Q6NZL0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Soga3Q6NZL0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga3Q6NZL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga3Q6NZL0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Soga3Q6NZL0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga3Q6NZL0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga3Q6NZL0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Soga3Q6NZL0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Soga3Q6NZL0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Soga3Q6NZL0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Soga3Q6NZL0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Soga3Q6NZL0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Soga3Q6NZL0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Soga3Q6NZL0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Soga3Q6NZL0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Soga3Q6NZL0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Soga3Q6NZL0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Soga3Q6NZL0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Soga3Q6NZL0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Soga3Q6NZL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Soga3Q6NZL0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Soga3Q6NZL0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Soga3Q6NZL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Soga3Q6NZL0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
Soga3Q6NZL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Soga3Q6NZL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Soga3Q6NZL0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Soga3Q6NZL0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Soga3Q6NZL0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Soga3Q6NZL0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Soga3Q6NZL0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms