Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SphkapQ6NSW3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
SphkapQ6NSW3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SphkapQ6NSW3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SphkapQ6NSW3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SphkapQ6NSW3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SphkapQ6NSW3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SphkapQ6NSW3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SphkapQ6NSW3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SphkapQ6NSW3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SphkapQ6NSW3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
SphkapQ6NSW3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SphkapQ6NSW3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SphkapQ6NSW3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
SphkapQ6NSW3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SphkapQ6NSW3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SphkapQ6NSW3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SphkapQ6NSW3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SphkapQ6NSW3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SphkapQ6NSW3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SphkapQ6NSW3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SphkapQ6NSW3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SphkapQ6NSW3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SphkapQ6NSW3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SphkapQ6NSW3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SphkapQ6NSW3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SphkapQ6NSW3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SphkapQ6NSW3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SphkapQ6NSW3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SphkapQ6NSW3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SphkapQ6NSW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SphkapQ6NSW3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SphkapQ6NSW3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SphkapQ6NSW3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
SphkapQ6NSW3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SphkapQ6NSW3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SphkapQ6NSW3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SphkapQ6NSW3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SphkapQ6NSW3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SphkapQ6NSW3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SphkapQ6NSW3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SphkapQ6NSW3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SphkapQ6NSW3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SphkapQ6NSW3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SphkapQ6NSW3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SphkapQ6NSW3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SphkapQ6NSW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms