Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PnkdQ69ZP3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnkdQ69ZP3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnkdQ69ZP3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkdQ69ZP3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkdQ69ZP3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnkdQ69ZP3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PnkdQ69ZP3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PnkdQ69ZP3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnkdQ69ZP3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms