Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Gja3Q64448 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Gja3Q64448 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gja3Q64448 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Gja3Q64448 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Gja3Q64448 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Gja3Q64448 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gja3Q64448 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gja3Q64448 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gja3Q64448 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Gja3Q64448 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Gja3Q64448 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gja3Q64448 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Gja3Q64448 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gja3Q64448 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gja3Q64448 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gja3Q64448 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Gja3Q64448 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Gja3Q64448 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Gja3Q64448 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Gja3Q64448 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Gja3Q64448 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gja3Q64448 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gja3Q64448 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gja3Q64448 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Gja3Q64448 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Gja3Q64448 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,7 ms