Protein–RNA interactions for Protein: Q63739

Ptp4a1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a1Q63739 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptp4a1Q63739 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptp4a1Q63739 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptp4a1Q63739 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptp4a1Q63739 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptp4a1Q63739 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptp4a1Q63739 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptp4a1Q63739 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptp4a1Q63739 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptp4a1Q63739 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptp4a1Q63739 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptp4a1Q63739 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptp4a1Q63739 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptp4a1Q63739 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms