Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx1Q62443 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nptx1Q62443 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx1Q62443 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nptx1Q62443 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nptx1Q62443 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nptx1Q62443 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nptx1Q62443 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx1Q62443 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx1Q62443 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nptx1Q62443 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms