Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff3Q62395 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff3Q62395 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tff3Q62395 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff3Q62395 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tff3Q62395 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tff3Q62395 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tff3Q62395 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tff3Q62395 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tff3Q62395 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff3Q62395 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tff3Q62395 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tff3Q62395 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tff3Q62395 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tff3Q62395 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff3Q62395 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff3Q62395 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tff3Q62395 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms