Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,75
Supt6hQ62383 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Supt6hQ62383 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Supt6hQ62383 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Supt6hQ62383 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Supt6hQ62383 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Supt6hQ62383 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Supt6hQ62383 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38,36■■■■□ 3,73
Supt6hQ62383 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Supt6hQ62383 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Supt6hQ62383 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Supt6hQ62383 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Supt6hQ62383 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Supt6hQ62383 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38,26■■■■□ 3,72
Supt6hQ62383 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Supt6hQ62383 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Supt6hQ62383 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Supt6hQ62383 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Supt6hQ62383 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Supt6hQ62383 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Supt6hQ62383 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Supt6hQ62383 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Supt6hQ62383 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Supt6hQ62383 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,13■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38,13■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Supt6hQ62383 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38,05■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38,02■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,01■■■■□ 3,68
Supt6hQ62383 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38,01■■■■□ 3,67
Supt6hQ62383 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38,01■■■■□ 3,67
Supt6hQ62383 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Supt6hQ62383 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Supt6hQ62383 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37,96■■■■□ 3,67
Supt6hQ62383 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Supt6hQ62383 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37,91■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Supt6hQ62383 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Supt6hQ62383 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Supt6hQ62383 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,82■■■■□ 3,65
Supt6hQ62383 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Supt6hQ62383 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Supt6hQ62383 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37,81■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37,76■■■■□ 3,64
Supt6hQ62383 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37,7■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Supt6hQ62383 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Supt6hQ62383 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Supt6hQ62383 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Supt6hQ62383 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Supt6hQ62383 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Supt6hQ62383 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,6■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Supt6hQ62383 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Supt6hQ62383 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Supt6hQ62383 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Supt6hQ62383 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms