Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Six2Q62232 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Six2Q62232 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Six2Q62232 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Six2Q62232 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Six2Q62232 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Six2Q62232 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Six2Q62232 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Six2Q62232 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Six2Q62232 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Six2Q62232 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Six2Q62232 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Six2Q62232 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Six2Q62232 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Six2Q62232 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Six2Q62232 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Six2Q62232 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Six2Q62232 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Six2Q62232 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Six2Q62232 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Six2Q62232 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Six2Q62232 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Six2Q62232 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Six2Q62232 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Six2Q62232 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Six2Q62232 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Six2Q62232 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms