Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema4bQ62179 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema4bQ62179 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema4bQ62179 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sema4bQ62179 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema4bQ62179 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema4bQ62179 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema4bQ62179 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema4bQ62179 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema4bQ62179 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms