Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprrQ62132 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprrQ62132 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprrQ62132 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprrQ62132 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprrQ62132 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprrQ62132 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprrQ62132 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprrQ62132 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprrQ62132 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprrQ62132 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprrQ62132 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprrQ62132 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprrQ62132 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprrQ62132 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprrQ62132 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprrQ62132 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 510.7 ms