Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna1eQ61290 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cacna1eQ61290 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1eQ61290 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacna1eQ61290 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna1eQ61290 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1eQ61290 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna1eQ61290 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1eQ61290 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1eQ61290 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1eQ61290 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1eQ61290 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1eQ61290 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1eQ61290 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1eQ61290 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1eQ61290 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1eQ61290 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1eQ61290 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1eQ61290 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1eQ61290 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1eQ61290 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1eQ61290 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1eQ61290 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1eQ61290 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1eQ61290 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms