Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sntb2Q61235 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sntb2Q61235 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sntb2Q61235 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sntb2Q61235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sntb2Q61235 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sntb2Q61235 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntb2Q61235 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sntb2Q61235 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sntb2Q61235 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sntb2Q61235 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntb2Q61235 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntb2Q61235 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntb2Q61235 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms