Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
OclnQ61146 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
OclnQ61146 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
OclnQ61146 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,65■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
OclnQ61146 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,64■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
OclnQ61146 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,59■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
OclnQ61146 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
OclnQ61146 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,51■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,47■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
OclnQ61146 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,41■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
OclnQ61146 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
OclnQ61146 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23,36■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
OclnQ61146 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
OclnQ61146 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,32■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
OclnQ61146 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,26■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
OclnQ61146 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,7 ms