Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ift20Q61025 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ift20Q61025 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ift20Q61025 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ift20Q61025 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ift20Q61025 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ift20Q61025 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ift20Q61025 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ift20Q61025 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ift20Q61025 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms