Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp7Q60973 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp7Q60973 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp7Q60973 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp7Q60973 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp7Q60973 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbbp7Q60973 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp7Q60973 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp7Q60973 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp7Q60973 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbbp7Q60973 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbbp7Q60973 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp7Q60973 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp7Q60973 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp7Q60973 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp7Q60973 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp7Q60973 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp7Q60973 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp7Q60973 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms