Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctf1Q60753 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctf1Q60753 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctf1Q60753 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctf1Q60753 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctf1Q60753 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctf1Q60753 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctf1Q60753 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctf1Q60753 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctf1Q60753 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms