Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CluhQ5SW19 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CluhQ5SW19 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CluhQ5SW19 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CluhQ5SW19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CluhQ5SW19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CluhQ5SW19 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CluhQ5SW19 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CluhQ5SW19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CluhQ5SW19 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CluhQ5SW19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CluhQ5SW19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CluhQ5SW19 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CluhQ5SW19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CluhQ5SW19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CluhQ5SW19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CluhQ5SW19 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms