Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctc1Q5SUQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctc1Q5SUQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctc1Q5SUQ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ctc1Q5SUQ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctc1Q5SUQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctc1Q5SUQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ctc1Q5SUQ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctc1Q5SUQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctc1Q5SUQ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctc1Q5SUQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctc1Q5SUQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctc1Q5SUQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctc1Q5SUQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctc1Q5SUQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctc1Q5SUQ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctc1Q5SUQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctc1Q5SUQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctc1Q5SUQ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms