Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc92bQ5SUE3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc92bQ5SUE3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc92bQ5SUE3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc92bQ5SUE3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc92bQ5SUE3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc92bQ5SUE3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms