Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgap44Q5SSM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgap44Q5SSM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgap44Q5SSM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Arhgap44Q5SSM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap44Q5SSM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap44Q5SSM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap44Q5SSM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap44Q5SSM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap44Q5SSM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms