Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TefmQ5SSK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TefmQ5SSK3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TefmQ5SSK3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TefmQ5SSK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TefmQ5SSK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TefmQ5SSK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TefmQ5SSK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TefmQ5SSK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TefmQ5SSK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TefmQ5SSK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TefmQ5SSK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms