Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh12Q5RJH3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh12Q5RJH3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh12Q5RJH3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh12Q5RJH3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh12Q5RJH3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh12Q5RJH3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh12Q5RJH3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh12Q5RJH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh12Q5RJH3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms