Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trdv2-2Q5R1A4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trdv2-2Q5R1A4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trdv2-2Q5R1A4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trdv2-2Q5R1A4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms