Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp13Q5BKP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp13Q5BKP2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp13Q5BKP2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp13Q5BKP2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp13Q5BKP2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp13Q5BKP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp13Q5BKP2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp13Q5BKP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp13Q5BKP2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp13Q5BKP2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp13Q5BKP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp13Q5BKP2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp13Q5BKP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp13Q5BKP2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp13Q5BKP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp13Q5BKP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp13Q5BKP2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp13Q5BKP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp13Q5BKP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp13Q5BKP2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp13Q5BKP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp13Q5BKP2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp13Q5BKP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp13Q5BKP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms