Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd5Q3V1H9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Samd5Q3V1H9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd5Q3V1H9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd5Q3V1H9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd5Q3V1H9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd5Q3V1H9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd5Q3V1H9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samd5Q3V1H9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd5Q3V1H9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms