Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn34b4Q3V0X2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn34b4Q3V0X2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn34b4Q3V0X2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b4Q3V0X2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cldn34b4Q3V0X2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn34b4Q3V0X2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34b4Q3V0X2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms