Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc27Q3V036 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc27Q3V036 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc27Q3V036 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc27Q3V036 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc27Q3V036 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc27Q3V036 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc27Q3V036 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc27Q3V036 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc27Q3V036 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc27Q3V036 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc27Q3V036 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc27Q3V036 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc27Q3V036 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ccdc27Q3V036 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc27Q3V036 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms