Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hipk4Q3V016 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hipk4Q3V016 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hipk4Q3V016 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hipk4Q3V016 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hipk4Q3V016 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hipk4Q3V016 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hipk4Q3V016 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hipk4Q3V016 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hipk4Q3V016 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hipk4Q3V016 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms