Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrfip1Q3UZ39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrfip1Q3UZ39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrfip1Q3UZ39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrfip1Q3UZ39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrfip1Q3UZ39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrfip1Q3UZ39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrfip1Q3UZ39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrfip1Q3UZ39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrfip1Q3UZ39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrrfip1Q3UZ39 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrfip1Q3UZ39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrfip1Q3UZ39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrfip1Q3UZ39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms