Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaaf3Q3UYV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaaf3Q3UYV8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaaf3Q3UYV8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf3Q3UYV8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf3Q3UYV8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnaaf3Q3UYV8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaaf3Q3UYV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms