Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim40Q3UWA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim40Q3UWA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim40Q3UWA4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim40Q3UWA4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim40Q3UWA4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim40Q3UWA4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim40Q3UWA4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim40Q3UWA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim40Q3UWA4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim40Q3UWA4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim40Q3UWA4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim40Q3UWA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms