Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca4bQ3UW98 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca4bQ3UW98 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca4bQ3UW98 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca4bQ3UW98 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca4bQ3UW98 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca4bQ3UW98 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca4bQ3UW98 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca4bQ3UW98 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca4bQ3UW98 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms