Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd4Q3UTY6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd4Q3UTY6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd4Q3UTY6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thsd4Q3UTY6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thsd4Q3UTY6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thsd4Q3UTY6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thsd4Q3UTY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thsd4Q3UTY6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thsd4Q3UTY6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thsd4Q3UTY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thsd4Q3UTY6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thsd4Q3UTY6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thsd4Q3UTY6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Thsd4Q3UTY6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thsd4Q3UTY6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd4Q3UTY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thsd4Q3UTY6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms