Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smim15Q3UTD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim15Q3UTD9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim15Q3UTD9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim15Q3UTD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim15Q3UTD9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim15Q3UTD9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms