Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130208F15RikQ3UPV3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E130208F15RikQ3UPV3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms