Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Skap2Q3UND0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Skap2Q3UND0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Skap2Q3UND0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms