Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smu1Q3UKJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smu1Q3UKJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smu1Q3UKJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smu1Q3UKJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smu1Q3UKJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smu1Q3UKJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smu1Q3UKJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smu1Q3UKJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smu1Q3UKJ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms