Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms